数据集概述
本数据集包含德国巴伐利亚森林粗木质残体(CWD)中的真菌群落提取序列,采样时间为2012、2013和2015年。数据来自2011年建立的枯木实验(67个树干,含欧洲山毛榉和银杉),通过ITS2区域PCR扩增获得OTU序列,记录了森林间隙与郁闭林分处理下的真菌分类信息及群落组成,聚焦于丰富OTU分析。
文件详解
- metadata_taxinfo_bavarianforest.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含采样相关元数据及真菌分类信息,可能涉及样本处理方式(森林间隙/郁闭林分)、OTU分类注释、样本来源等与Rieker et al. (2024)研究相关的丰富OTU参考信息。
- CWD2012_2013_2015.fas
- 文件格式:FAS
- 字段映射介绍:包含2012-2015年巴伐利亚森林粗木质残体真菌群落的OTU核苷酸序列数据,基于ITS2区域PCR扩增结果,记录真菌群落的序列信息。
数据来源
Rieker et al. (2024): How to best detect threatened deadwood fungi – comparing metabarcoding and fruit body surveys. Biological Conservation.、Baldrian et al. (2016): Fungi associated with decomposing deadwood in a natural beech-dominated forest. Fungal ecology, 23, 109-122.
适用场景
- 森林枯木真菌群落研究: 分析粗木质残体中真菌OTU的组成、多样性及时间动态变化。
- 森林微生境差异分析: 比较森林间隙与郁闭林分处理下真菌群落的结构差异。
- 濒危枯木真菌检测方法研究: 支持元条形码技术与子实体调查方法的对比分析。
- 森林生态系统物质循环研究: 探究真菌在粗木质残体分解过程中的作用。