巴西西亚马逊地区SARS_COV_2基因组监测数据集

数据集概述

该数据集为巴西西亚马逊地区SARS-COV-2基因组监测研究的生成数据,包含疫情传播进化史与遗传特征分析所需的文件,涵盖序列比对、分子钟分析及信号时间评估结果等核心内容,支持相关基因组学研究。

文件详解

数据集包含8个文件,均位于Generated data/目录下,具体说明如下: - 样本序列与元数据文件: - Sample_Sequences_GISAID_Metadata.zip:ZIP格式,可能包含GISAID来源的样本序列及元数据 - 数据集A相关文件: - DATASET-A_Alignament_by_MAFFT.fas:FAS格式,通过MAFFT工具生成的数据集A序列比对文件 - Files_of_Molecular-Clock_Analysis_in_DATASET-A.zip:ZIP格式,数据集A的分子钟分析文件 - Files_of_Non-Clock_Analysis_for_Signal-Temporal_Evaluation_on_DATASET-A.zip:ZIP格式,数据集A的非钟模型信号时间评估文件 - 数据集B相关文件: - DATASET-B_Alignament_by_MAFFT.fas:FAS格式,通过MAFFT工具生成的数据集B序列比对文件 - Files_of_Molecular-Clock_Analysis_in_DATASET-B.zip:ZIP格式,数据集B的分子钟分析文件 - Files_of_Non-Clock_Analysis_for_Signal-Temporal_Evaluation_on_DATASET-B.zip:ZIP格式,数据集B的非钟模型信号时间评估文件 - 突变分析文件: - Alignament_for_Mutation_Analysis.fas:FAS格式,用于突变分析的序列比对文件

适用场景

  • 基因组进化研究:分析巴西西亚马逊地区SARS-COV-2的传播进化历史
  • 分子钟分析:探究病毒的演化速率与时间线
  • 遗传特征研究:识别该地区病毒的特异性遗传标记
  • 疫情传播动力学:结合基因组数据研究病毒传播模式
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 269.76 MiB
最后更新 2025年11月26日
创建于 2025年11月26日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。