数据集概述
本数据集为蛙壶菌（Bd）感染实验的转录组研究数据，针对具有种内易感性差异的亚瓦派蛙（Rana yavapaiensis），分析其皮肤和脾脏在感染过程中不同时间点的转录组响应，探究免疫基因表达与感染存活结果的关联，特别是MHC IIβ基因表达及等位基因多样性与存活的负相关关系。
文件详解
- 文件名称：
R_yava_RNAseq_Bd_over_time.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含亚瓦派蛙在Bd感染实验中，皮肤和脾脏组织在不同感染时间点的转录组数据，涉及免疫基因表达量、MHC IIβ基因表达水平、等位基因多样性及感染强度等关联分析信息。
数据来源
论文“Sustained immune activation is associated with susceptibility to the amphibian chytrid fungus”
适用场景
- 两栖动物免疫响应研究：分析蛙类感染蛙壶菌后的皮肤和脾脏转录组动态变化，探究免疫激活与存活的关联机制。
- MHC基因功能研究：评估MHC IIβ基因表达量、等位基因多样性与蛙壶菌感染易感性的关系。
- 蛙壶菌病防治策略开发：基于免疫响应与存活的负相关结果，优化两栖动物蛙壶菌病的保护干预方案。
- 物种易感性差异机制分析：解析亚瓦派蛙种内对蛙壶菌感染易感性差异的分子基础。
