数据集概述
该数据集包含BE(2)-C神经母细胞瘤细胞中Brunello全基因组敲除文库经INKV存活筛选后的下一代测序(NGS)数据,记录了筛选后文库群体的基因敲除相关序列信息。
文件详解
数据集包含一个目录及6个FASTQ格式文件,具体如下:
- 目录: Brunello Whole Genome Knockout library in BE(2)-C/
- 文件列表(均为.fastq格式):
- INKV Cont1.fastq: 对照组1的NGS原始测序数据
- INKV Cont2.fastq: 对照组2的NGS原始测序数据
- INKV Cont3.fastq: 对照组3的NGS原始测序数据
- INKV Rep1.fastq: 实验组重复1的NGS原始测序数据
- INKV Rep2.fastq: 实验组重复2的NGS原始测序数据
- INKV Rep3.fastq: 实验组重复3的NGS原始测序数据
数据来源
Addgene (#73178,David Root和John Doench馈赠)、ATCC CRL-2268
适用场景
- 功能基因组学研究: 分析INKV感染存活相关的关键基因
- 肿瘤生物学研究: 探究神经母细胞瘤细胞对INKV的抗性机制
- CRISPR筛选数据分析: 验证全基因组敲除文库筛选结果的可靠性
- 病毒-宿主相互作用研究: 识别调控INKV在BE(2)-C细胞中复制的宿主因子