BEDASSLE_Based_三刺鱼基因组分化影响因素研究数据

数据集概述

本数据集为三刺鱼(Gasterosteus aculeatus)种群基因组分化研究的相关数据,包含对温哥华岛三个湖溪种群的部分基因组数据,使用BEDASSLE软件分析地理隔离(IBD)、环境隔离(IBE)及物理屏障对基因组分化的影响,支持IBD和IBE作用,并探讨非随机扩散的贡献。

文件详解

  • 元数据文件(CSV格式)
  • 文件名称:Metadata_Comida.csv、Metadata_Roberts.csv、Metadata_Farewell.csv
  • 文件格式:CSV
  • 字段映射介绍:包含fish_id(鱼ID)、Barcode(条形码)、Year(年份)、Lake_stream(湖/溪)、distance(距离)、habitat(栖息地)、pair(种群对)、site(位点)、sex(性别)、mass(质量)、sl(体长)、bd(体宽)等表型与采样信息
  • 说明文档
  • 文件名称:README.txt、README_for_Bedassle_Data_Files_Evolution.rtf
  • 文件格式:TXT、RTF
  • 内容介绍:提供数据集的背景说明、数据处理方法及BEDASSLE分析相关的使用指南
  • 分析数据压缩包
  • 文件名称:Bedassle_Data_Files_Evolution.zip
  • 文件格式:ZIP
  • 内容介绍:包含用于BEDASSLE软件分析的基因组分化相关数据文件

数据来源

论文“Partitioning the effects of isolation by distance, environment, and physical barriers on genomic divergence between parapatric threespine stickleback”

适用场景

  • 种群基因组分化机制研究:分析地理隔离、环境隔离及物理屏障对三刺鱼种群基因组分化的相对贡献
  • 进化生物学分析:探讨非随机扩散(如栖息地选择)在微地理尺度遗传分化中的作用
  • 表型与基因型关联研究:结合元数据中的表型信息与基因组数据,分析表型差异的遗传基础
  • 种群遗传软件应用验证:为BEDASSLE等种群遗传分析软件的应用提供实际数据案例
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 0.67 MiB
最后更新 2026年1月29日
创建于 2026年1月29日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。