北美树花属_梅衣科_分子研究数据集

数据集概述

本数据集聚焦北美树花属(Alectoria)地衣的分子系统发育研究,通过ITS和Mcm7两个核基因分析9个类群的48个样本,探讨5个与A. sarmentosa相关或易混淆类群的分类界限,提出临时分类处理建议及新物种组合,并提供北美树花属物种检索表。

文件详解

  • 分子数据文件(.nex格式):包含4个NEXUS格式的分子序列文件,如BI_Alectoria_COMBINED.nex、AlecITSNEX4.phy(注:实际格式为.nex)等,存储ITS和Mcm7基因的序列数据,用于系统发育分析
  • 分子数据文件(.phy格式):包含4个PHYLIP格式的分子序列文件,如ALECMCM7NEX2.phy(注:实际格式为.phy)、ML_alectoria_ITS_MCM7_combined.phy等,存储ITS和Mcm7基因的序列数据,适配不同分析软件
  • 系统发育分析结果文件(.pdf格式):包含4个PDF格式的系统发育树文件,如RAxML_bipartitions.Alectoria_ITS_ML.pdf、RAxML_bipartitions.Alectoria_combined_ITS_MCM7_ML.pdf等,展示基于不同基因及组合数据的最大似然法(ML)分析结果,带有分支支持值

适用场景

  • 地衣分类学研究:验证北美树花属物种的分类界限,支持分类修订工作
  • 分子系统发育分析:作为案例数据,用于测试或演示基于ITS和Mcm7基因的地衣系统发育分析方法
  • 生物多样性研究:辅助理解北美树花属地衣的物种多样性及分布格局
  • 分类学教学:作为分子分类学实践的教学案例,展示从基因序列到分类结论的研究流程
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 0.44 MiB
最后更新 2025年12月13日
创建于 2025年12月13日
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