数据集概述
该数据集围绕北美鼠蛇复合体（Pantherophis obsoletus）的物种形成灰色地带展开，结合种群基因组数据、景观特征与气候因素，分析谱系分化时间、迁移率与杂交带动态的关联，揭示不完全生殖隔离的形成机制。
文件详解
- 文档类文件（PDF格式，共7个）：
- Supporting_Information_Final5.pdf：支持信息文档
- Fig.S5._migration_no_hybrids_suppl.pdf：无杂交个体迁移分析图
- Fig.S4._expansion_Times.pdf：扩张时间分析图
- Fig.S1_SMNF_sPCA.pdf：空间主成分分析图
- Fig.S6_Cline_width_new.pdf：杂交带宽度分析图
- Fig.S2.DAPC_TESS_K_2_5.pdf：种群结构分析图
- 表格类文件：
- Table_S1_PipeMaster_sumarry_stats_priors.docx：模型先验统计摘要表格
- Table_S2_results_phrapl.txt：谱系分化分析结果文本
- 代码文件：
- Data_S2_Final_Rats_Code.R：R语言分析代码
- 数据文件：
- Data_S5.fastas_unfiltered.zip：未过滤的基因组序列压缩包
- Data_S4_Pan_obs_pop_assigns_PCA_Lat_Long.txt：种群分配与地理坐标数据，包含INDIVIDUAL（个体ID）、STRATA（种群分层）、lat（纬度）、long（经度）等字段
- Data_S3_Pan_obs_maf.1_thin.vcf：过滤后的基因型数据文件
- Data_S1_Sequenced_Sample_Locality_Ratsnakes_.xlsx：测序样本地理信息表格
适用场景
- 进化生物学研究：分析物种形成灰色地带的不完全生殖隔离机制
- 种群基因组学分析：探究杂交带动态与谱系分化时间的关联
- 景观遗传学研究：评估景观特征对种群遗传结构的影响
- 生物信息学应用：验证人工神经网络在基因组数据分析中的效果
