数据集概述
本数据集围绕北美树蛙(Hyla eximia群)的线粒体渐渗现象展开,包含线粒体DNA(mtDNA)与核基因的进化历史重建、比较及渐渗检测数据,结合地理分布信息,为解析该类群系统发育与生物地理学提供支持。
文件详解
该数据集包含16个文件,按类型分为以下几类:
- 说明文档(PDF格式,共8个):
- README_for_cryba_NEXUS.pdf、README_for_pomc_NEXUS.pdf、README_for_tyr1_NEXUS.pdf:核基因(cryba、pomc、tyr1)相关NEXUS文件的说明文档
- README_for_Hyla_ATP6.pdf、README_for_Hyla_tRNA.pdf、README_for_Hyla_ND4.pdf、README_for_Hyla_ATP8.pdf:线粒体基因(ATP6、tRNA、ND4、ATP8)相关文件的说明文档
- README_for_Hyla_mtDNA_all.pdf:全线粒体DNA数据集的说明文档
- 序列数据文件(NEX格式,共5个):
- Hyla_ATP8.nex、Hyla_tRNA.nex、Hyla_ATP6.nex、Hyla_mtDNA_all.nex、Hyla_ND4.nex:线粒体基因及全mtDNA的序列数据文件
- 序列数据文件(NEXUS格式,共3个):
- tyr1_NEXUS.nexus、pomc_NEXUS.nexus、cryba_NEXUS.nexus:核基因的序列数据文件
适用场景
- 进化生物学研究:分析线粒体与核基因的系统发育冲突及渐渗事件
- 生物地理学分析:结合地理分布解析树蛙类群的历史扩散与分化
- 分子生态学研究:探究杂交事件对物种进化历史的影响
- 系统发育方法验证:测试不同基因数据集在物种树重建中的适用性