数据集概述
本数据集聚焦被子植物进化时间尺度研究,包含195个分类群(覆盖86科)的76个叶绿体基因组蛋白编码基因数据,通过贝叶斯放松分子钟方法评估模型、先验和基因采样对时间估计的影响,提出冠群被子植物起源于三叠纪(221Ma)的结论。
文件详解
- 文件名称:Supplementary Tables.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包内包含研究相关的补充表格,可能涵盖分类群信息、化石校准参数、模型设置及时间估计结果等结构化数据
- 文件名称:Appendix 1.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:附录文档,可能包含研究方法细节、补充分析说明、原始数据处理流程等文本内容
- 文件名称:SI_alignment_195_taxa.nex
- 文件格式:NEX
- 字段映射介绍:195个分类群的序列比对文件,包含76个叶绿体基因的核苷酸或氨基酸序列比对数据,用于分子钟分析
- 文件名称:Supplementary Figures.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包内包含研究相关的补充图表,可能涵盖时间树可视化、敏感性分析结果、模型参数分布等图形化数据
数据来源
论文“Evaluating the impact of genomic data and priors on Bayesian estimates of the angiosperm evolutionary timescale”
适用场景
- 分子进化研究:用于分析被子植物进化时间尺度的分子钟估计方法及影响因素
- 植物系统发育分析:基于叶绿体基因组数据构建被子植物系统发育树并推断分化时间
- 化石校准方法评估:对比不同化石校准策略(均匀先验vs伽马先验)对时间估计的影响
- 进化生物学模型优化:研究 birth-death 树先验和分支速率变异模型对结果的敏感性
- 生物多样性起源分析:为被子植物早期演化历史及冠群起源时间提供分子证据支持