数据集概述
本数据集为Bin2基因敲除与生殖寿命改善机制研究的补充数据,包含5个文件,涵盖小鼠交配随机分配表、卵巢磷酸化位点、蛋白质表达及基因表达FPKM值等信息,支撑Bin2通过RPS6和NNT调控生殖寿命的实验结论,适用于生殖生物学与衰老机制研究。
文件详解
- Supplementary Dataset 1.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:WT交配雄鼠的随机分配表,记录雄鼠每月在笼间轮换的随机分配信息,支撑生育力检测实验设计
- Supplementary Dataset 2.xlsx
- 文件格式:XLSX,含3个工作表
- 字段映射介绍:
- All identified phospho sites:WT与Bin2-KO小鼠PND-21卵巢2次重复的所有磷酸化位点值及鉴定信息
- Bin2-KO vs WT ≥1.2 up:Bin2-KO组较WT组上调≥1.2倍的差异磷酸化位点值及信息
- Bin2-KO vs WT ≤0.83 down:Bin2-KO组较WT组下调≤0.83倍的差异磷酸化位点值及信息
- Supplementary Dataset 3.xlsx
- 文件格式:XLSX,含3个工作表
- 字段映射介绍:
- All identified proteins:WT与Bin2-KO小鼠PND-21卵巢2次重复的所有蛋白表达值及鉴定信息
- Bin2-KO vs WT ≥1.2 up:Bin2-KO组较WT组上调≥1.2倍的差异表达蛋白值及信息
- Bin2-KO vs WT ≤0.83 down:Bin2-KO组较WT组下调≤0.83倍的差异表达蛋白值及信息
- Supplementary Dataset 4.xlsx
- 文件格式:XLSX,含1个工作表
- 字段映射介绍:All gene expression-FPKM & Log2:PND-21 WT与Bin2-KO小鼠卵巢3次重复的所有基因FPKM值、Log2转换值及鉴定信息(原始值加0.001避免计算错误)
- Supplementary Dataset 5.xlsx
- 文件格式:XLSX,含4个工作表
- 字段映射介绍:
- All gene expression FPKM & Log2:2月龄、9月龄、9月龄+BPP处理小鼠3次重复的所有基因FPKM值、Log2转换值及鉴定信息(原始值加0.001避免计算错误)
- |Log2(Ave-2M)vs(Ave-9M)| ≥2:2月龄与9月龄组差异≥2倍的基因信息
- |Log2(Ave-9M-BPP)vs(Ave-9M)| ≥2:9月龄+BPP组与9月龄组差异≥2倍的基因信息
- 2Mvs9M-BPPvs9M overlap:上述两个差异基因集的重叠基因信息
数据来源
论文“Bridge Integrator 2, a New Specific Target for Improving Reproductive Life Span through RPS6 and NNT”
适用场景
- 生殖生物学研究:分析Bin2基因敲除对小鼠卵巢磷酸化修饰、蛋白表达及基因表达的影响,探究生殖寿命调控机制
- 衰老机制研究:对比不同月龄小鼠卵巢基因表达差异,研究BPP处理对衰老卵巢的修复作用
- 生育力改善研究:基于交配随机分配表与差异分子数据,开发靶向Bin2的生殖健康干预策略
- 生物医药靶点验证:验证Bin2作为改善生殖寿命靶点的有效性,支撑相关药物研发
- 组学数据分析:利用磷酸化组、蛋白质组及转录组数据,开展多组学联合分析,解析mTOR通路与NNT调控网络