BindDB假基因案例研究数据集

数据集概述

本数据集是基于BindDB平台的假基因案例研究资料,通过查询76个带"ps"后缀的假基因启动子区域,分析其表观遗传特征与转录活性,发现多数假基因呈无活性染色质状态,少数存在活性标记及转录因子结合。

文件详解

数据集包含一个PDF格式的文档文件,具体如下: - 文件名称: BindDB Pseudogenes Case Study/Pseudogenes Case Study.pdf - 文件格式: PDF (.pdf) - 文件内容: 记录了使用BindDB平台对假基因进行分析的研究过程,包括表观遗传标记(如H3K4me1、H3K27ac等)的富集情况、转录因子结合热图、RNA表达证据及部分特殊假基因(如Rpl34-ps、Pisd-ps1/2)的详细分析结果。

适用场景

  • 表观遗传学研究:分析假基因的染色质活性与组蛋白修饰特征
  • 基因组注释验证:识别可能被错误标注的假基因
  • 干细胞生物学研究:探究胚胎干细胞(ESCs)中假基因的表达调控机制
  • 生物信息学工具应用:验证BindDB平台在基因功能分析中的有效性
  • 非编码RNA研究:筛选具有活性的假基因作为ncRNA研究候选对象
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 0.29 MiB
最后更新 2025年11月28日
创建于 2025年11月27日
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