BindDB双价基因案例研究数据集

数据集概述

该数据集为基于BindDB平台开展的双价基因案例研究文档,聚焦人类和小鼠的双价基因(分别为3913个和2984个),验证其启动子区域同时存在H3K4me3活性标记与H3K27me3抑制标记的表观遗传特征,以及相关Polycomb复合物组分、转录因子的结合情况,支持胚胎干细胞中双价基因调控机制的研究。

文件详解

  • 文件名称: Bivalent Gene Case Study.pdf
  • 文件格式: PDF (.pdf)
  • 文件内容: 记录BindDB平台对双价基因的案例研究过程,包括基因列表上传、启动子区域(-1000至+1000)查询、富集分数分析结果,涉及组蛋白修饰(如H3K4me3、H3K27me3、H3K36me3)、Polycomb复合物组分(如PHF19、EZH1/2)及转录因子(如OCT4、SOX2)的结合特征分析。

适用场景

  • 表观遗传学研究: 分析胚胎干细胞中双价基因的表观遗传调控机制
  • 基因调控研究: 探究Polycomb复合物及转录因子在双价基因表达中的作用
  • 干细胞生物学研究: 研究胚胎干细胞中“ poised”状态基因的表观遗传特征
  • 生物信息学工具验证: 评估BindDB平台在基因表观遗传数据分析中的应用价值
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 0.37 MiB
最后更新 2025年11月26日
创建于 2025年11月26日
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