数据集概述
本数据集围绕高致病性禽流感H5N1病毒(HPAIV H5N1 clade 2.3.4.4b)的洲际传播展开,通过系统发育地理学分析,验证冰岛作为病毒从北欧向北美传播跳板的作用,包含2021-2022年冰岛两次独立病毒入侵事件的相关数据。
文件详解
- 系统发育树文件(.newick格式,共9个):如11_INT_ICE_ref_seg1_PB2_allreass__680__.newick,存储病毒基因片段的系统发育树结构数据
- 树可视化与分析文件(.trees及.pdf格式,共8个):如06_INT_ICE_ref_seg_concat_B2__86__MCC.trees.pdf,包含时间标度树的可视化结果及MCC树数据
- 地理分布文件(.kml格式,共2个):如07_INT_ICE_ref_seg_concat_B1__76__MCC.kml,记录病毒传播的地理信息
- 数据说明文件(.tsv及.csv格式,共2个):
- 19_INT_ICE_data_source_acknowledgment_table.tsv:包含病毒序列的 accession 号、名称、采集时间及国家等数据来源信息
- 00_INT_ICE_data_overview.csv:提供各文件的名称、简要描述、详细说明、格式、所用软件及数据关系
- 方法文档(.pdf格式):20_INT_ICE_methods.pdf,记录研究方法
适用场景
- 病毒学研究:分析HPAIV H5N1病毒的洲际传播路径及机制
- 系统发育地理学分析:探究冰岛在病毒跨大陆传播中的作用
- 流行病学调查:研究2021-2022年冰岛两次HPAIV入侵事件的关联性
- 公共卫生防控:为禽流感跨境传播的预警与防控策略制定提供数据支持