冰岛作为高致病性禽流感H5N1病毒洲际传播跳板的系统发育地理学分析数据集

数据集概述

本数据集围绕高致病性禽流感H5N1病毒(HPAIV H5N1 clade 2.3.4.4b)的洲际传播展开,通过系统发育地理学分析,验证冰岛作为病毒从北欧向北美传播跳板的作用,包含2021-2022年冰岛两次独立病毒入侵事件的相关数据。

文件详解

  • 系统发育树文件(.newick格式,共9个):如11_INT_ICE_ref_seg1_PB2_allreass__680__.newick,存储病毒基因片段的系统发育树结构数据
  • 树可视化与分析文件(.trees及.pdf格式,共8个):如06_INT_ICE_ref_seg_concat_B2__86__MCC.trees.pdf,包含时间标度树的可视化结果及MCC树数据
  • 地理分布文件(.kml格式,共2个):如07_INT_ICE_ref_seg_concat_B1__76__MCC.kml,记录病毒传播的地理信息
  • 数据说明文件(.tsv及.csv格式,共2个):
  • 19_INT_ICE_data_source_acknowledgment_table.tsv:包含病毒序列的 accession 号、名称、采集时间及国家等数据来源信息
  • 00_INT_ICE_data_overview.csv:提供各文件的名称、简要描述、详细说明、格式、所用软件及数据关系
  • 方法文档(.pdf格式):20_INT_ICE_methods.pdf,记录研究方法

适用场景

  • 病毒学研究:分析HPAIV H5N1病毒的洲际传播路径及机制
  • 系统发育地理学分析:探究冰岛在病毒跨大陆传播中的作用
  • 流行病学调查:研究2021-2022年冰岛两次HPAIV入侵事件的关联性
  • 公共卫生防控:为禽流感跨境传播的预警与防控策略制定提供数据支持
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 5.94 MiB
最后更新 2025年12月11日
创建于 2025年12月11日
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