数据集概述
本数据集包含BMAL1转录激活结构域(TAD)与PPIH蛋白相互作用的15N-1H ZZ交换核磁共振实验数据。数据通过不同时间延迟的ZZ交换实验获得,包含11个核磁共振谱图文件(.ft格式)和1个时间参数文件。化学位移数据可在BMRB(生物磁共振数据库)中查询,适用于研究蛋白质相互作用动力学和构象交换过程。
文件详解
- 核磁共振谱图文件
- 文件名称: ppih01.ft, ppih02.ft, ppih03.ft, ppih05.ft, ppih06.ft, ppih08.ft, ppih09.ft, ppih10.ft等(共11个文件)
- 文件格式: FT
- 字段映射介绍: 每个.ft文件对应一个特定时间延迟点的15N-1H ZZ交换核磁共振谱图数据,用于分析BMAL1 TAD与PPIH相互作用的动力学参数。
- 时间参数文件
- 文件名称: ppihtimes.txt
- 文件格式: TXT
- 字段映射介绍: 文件包含两列数据,第一列为文件编号(1-11),第二列为对应的时间延迟值(单位:秒),具体对应关系为:1(0s), 2(0.25s), 3(0.5s), 4(0.75s), 5(1s), 6(1.25s), 7(1.5s), 8(1.75s), 9(2s), 10(2.5s), 11(3s)。
数据来源
BMRB(生物磁共振数据库)
适用场景
- 蛋白质相互作用动力学研究: 通过ZZ交换实验分析BMAL1 TAD与PPIH蛋白的结合动力学和构象变化过程。
- 核磁共振谱图分析: 利用不同时间延迟的谱图数据研究蛋白质的化学交换和弛豫特性。
- 生物分子动力学建模: 为蛋白质相互作用的理论模型和分子动力学模拟提供实验验证数据。
- 结构生物学研究: 支持BMAL1转录激活结构域与其相互作用蛋白的结构功能关系分析。