数据集概述
本数据集来自结直肠癌(CRC)诊断信号生物标志物研究,通过高灵敏度等电聚焦技术检测正常黏膜与II、IV期CRC组织中EGFR信号通路相关蛋白(如AKT、ERK1/2、PLCγ1、c-SRC等)的表达及磷酸化水平,包含原始检测数据、重复校正特征数据及补充结果,用于构建CRC诊断的复合生物标志物模型。
文件详解
- Padhan BMC Cancer 2016 Raw Protein RPAs.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含Row(行号)、pAKT(磷酸化AKT)、TotalAKT(总AKT)、EGFR(表皮生长因子受体)、TotalMEK1or2(总MEK1/2)、ppERK1(双重磷酸化ERK1)、pERK1(磷酸化ERK1)、ppERK2(双重磷酸化ERK2)、pERK2(磷酸化ERK2)、ERK1(总ERK1)、ERK2(总ERK2)、pSRCP1-pSRCP6(不同形式磷酸化SRC)、SRCP2-SRCP6(不同形式总SRC)、PLCgamma(PLCγ1)、p70S6KP1-p70S6KP6(不同形式磷酸化p70S6K)、MutationKRAS(KRAS突变状态)、MutationBRAF(BRAF突变状态)等字段。
- Padhan BMC Cancer 2016 Raw Protein RPAs Constructed features replicate corrected.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:在原始数据基础上进行重复校正后的特征数据,字段与原始CSV文件一致。
- Padhan BMC Cancer 2016 Supplemental Results.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:研究的补充结果文件,具体内容未详细预览,推测包含实验补充数据、分析结果或图表说明。
数据来源
论文“High sensitivity isoelectric focusing to establish a signaling biomarker for the diagnosis of human colorectal cancer”
适用场景
- 结直肠癌诊断生物标志物研究:利用蛋白表达及磷酸化数据构建CRC诊断的复合生物标志物模型。
- 肿瘤信号通路分析:分析EGFR、AKT、ERK等信号通路在CRC中的异常调控机制。
- 肿瘤分期相关分子特征研究:对比II期与IV期CRC组织中信号蛋白的表达差异,探索分期相关分子特征。
- 医学诊断技术评估:评估高灵敏度等电聚焦技术在肿瘤生物标志物检测中的应用价值。