数据集概述
本数据集围绕斑马鱼fabp1基因展开,基于重复-退化-互补模型,研究其重复基因通过过氧化物酶体增殖物反应元件(PPRE)亚功能化实现保留的机制。通过序列分析、启动子活性检测等方法,对比斑马鱼fabp1a、fabp1b.1、fabp1b.2与斑点雀鳝祖先fabp1的PPAR调控差异,揭示基因保留的进化过程。
文件详解
- 文件名称:
Data from Laprairie et al 2016 BMC Evol Biol.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包内包含支持论文结论的实验数据,具体内容需解压后查看,推测涵盖fabp1基因启动子序列数据、PPAR激动剂激活实验的细胞活性检测数据、突变启动子报告基因构建体的转染实验数据等。
数据来源
论文“Subfunctionalization of peroxisome proliferator response elements accounts for retention of duplicated fabp1 genes in zebrafish”(BMC Evol Biol 2016)
适用场景
- 分子进化研究:分析重复基因通过亚功能化保留的机制,特别是启动子进化在基因功能分化中的作用。
- 基因调控机制研究:探究过氧化物酶体增殖物激活受体(PPAR)对fabp1基因家族的选择性调控模式。
- 比较基因组学分析:对比斑马鱼与斑点雀鳝fabp1基因的PPAR响应差异,追溯基因功能的进化轨迹。
- 转录调控元件研究:解析PPAR响应元件(PPRE)在不同fabp1基因启动子中的功能分化及突变影响。