数据集概述
本数据集为结肠炎小鼠模型研究的配套数据，包含脑与结肠样本的基因共表达模块富集分析、基因水平信息、非测序原始数据及各脑区不同时间点与对照组的差异表达分析结果，支持研究肠道 leaky gut 对脑内免疫激活、氧化应激及髓鞘化相关基因网络的调控机制。
文件详解
- 基因共表达与富集分析文件
- 文件名称：brain_module_enrichment.csv、brain_upregulated_module_enrichment_collapsed.csv、colon_module_enrichment.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含WGCNA鉴定的共表达模块富集分析统计结果，用于解析脑与结肠组织的基因功能模块
- 基因水平信息文件
- 文件名称：brain_wgcna_results.csv、colon_wgcna_results.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：涵盖基因所属模块标签、颜色，及基因与结肠远端/近端性别、体重等性状的关联统计（如GS值、p值、Z值）
- 非测序原始数据文件
- 文件名称：raw_data.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含论文中非测序分析的原始表格数据，支持多个主图与补充图的结果验证
- 差异表达分析文件（共26个CSV文件）
- 文件名称：遵循“[脑区] [时间点] v 0d.csv”模式（如HPC 7d v 0d.csv、CTX 9d v 0d.csv）
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含DESeq2分析结果，字段有baseMean、log2FoldChange、lfcSE、stat、pvalue、padj等，用于比较各脑区不同时间点与0d对照组的基因表达差异
数据来源
论文“A leaky gut dysregulates gene networks in the brain associated with immune activation, oxidative stress, and myelination in a mouse model of colitis”
适用场景
- 结肠炎小鼠模型脑-肠轴机制研究: 分析肠道 leaky gut 对脑内基因网络的调控效应，探索免疫激活、氧化应激及髓鞘化相关通路
- 基因共表达网络分析: 利用WGCNA结果解析脑与结肠组织中基因模块的功能及与表型的关联
- 差异基因表达分析: 研究各脑区（如HPC、CTX、MB）在不同时间点的基因表达变化规律
- 非测序实验数据验证: 通过raw_data.xlsx复现论文中非测序分析的结果，支持实验结论的验证与拓展
