数据集概述
本数据集为Porro et al.关于地中海蛇锁海葵（Anemonia viridis）共生菌水平获取机制研究的补充数据，包含宿主动物单核苷酸多态性（SNPs）数据、共生菌ITS2序列数据及共生菌组成表格，用于分析宿主与共生菌群落的关联模式及水平获取能力。
文件详解
- README.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：数据集说明文档，介绍数据来源为Porro et al.的研究，说明各文件对应的实验数据类型及获取方法
- ITS2_seq-TempA.fas
- 文件格式：FAS（FASTA）
- 字段映射介绍：SymPortal分析得到的共生菌ITS2 rDNA序列数据，序列通过Illumina测序获取
- N197dataset.vcf、N65dataset.vcf
- 文件格式：VCF
- 字段映射介绍：宿主动物Anemonia viridis smaragdina的SNPs数据，通过RAD测序技术获得
- Names_table-Symbiont_composition.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：共生菌组成表格，记录宿主共生菌群落的组成信息
数据来源
Porro et al.研究论文“Horizontal acquisition of Symbiodiniaceae in the Anemonia viridis (Cnidaria, Anthozoa) species complex”
适用场景
- 海洋共生关系研究: 分析Anemonia viridis与Symbiodiniaceae共生菌的水平获取机制及宿主-共生菌关联模式
- 宿主遗传多样性分析: 利用VCF文件中的SNPs数据研究Anemonia viridis宿主的遗传多样性及谱系特征
- 共生菌群落结构分析: 通过ITS2序列数据和组成表格，探究不同地理来源宿主的共生菌群落差异
- 海洋生态适应性研究: 结合宿主与共生菌数据，研究共生体系的环境适应性及表型可塑性机制
