数据集概述
本数据集记录伯氏疏螺旋体(Borrelia burgdorferi)不同菌株经蜱叮咬感染实验室啮齿动物(C3H/HeJ小鼠)后的组织感染情况,包含不同性别宿主在感染后不同时间点的耳组织活检及尸检组织的病原体载量数据,用于分析菌株类型与宿主性别对病原体感染率和丰度的影响。
文件详解
- 文件名称:README.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:文档类文件,推测包含实验背景、数据采集方法、文件说明等研究相关补充信息。
- 文件名称:Ear_punch_qPCR_data.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含Treatment(处理)、Status(状态)、Strain(菌株)、Punch(活检时间点)、Mouse(小鼠编号)、Cq(荧光定量循环数)、tissue.mg(组织重量)、spiro.tissue.mg(组织螺旋体载量)、log.spiro.tissue.mg(对数转换载量)、DNA ng/ul(DNA浓度)、spiro.per.million.beta(每百万β基因拷贝的螺旋体数)等耳组织活检qPCR检测数据字段。
- 文件名称:necropsy_tissue_qPCR_masterfile.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含Treatment(处理)、Status(状态)、Strain(菌株)、Mouse(小鼠编号)、Tissue(组织类型)、necrop.plate(尸检平板编号)、Cq(荧光定量循环数)、tissue.mg(组织重量)、spiro.tissue.mg(组织螺旋体载量)、log.spiro.tissue.mg(对数转换载量)、DNA.conc.ng.ul(DNA浓度)、spiro.per.million.beta(每百万β基因拷贝的螺旋体数)等尸检组织qPCR检测数据字段。
适用场景
- 病原体感染特性研究:分析伯氏疏螺旋体不同菌株在啮齿动物组织中的感染率与丰度差异。
- 宿主性别影响机制分析:探究宿主性别对伯氏疏螺旋体组织感染载量的影响规律。
- 实验室与自然菌株关联性研究:验证实验室菌株载量数据对自然蜱传病原体菌株组成的预测价值。
- 感染动态监测:通过不同时间点耳组织活检数据,研究伯氏疏螺旋体在宿主体内的感染动态变化。