数据集概述
本数据集用于研究自然田鼠-疏螺旋体系统中MHC II类（DQB）基因型与病原体基因型的互作关系对感染率的影响，验证负频率依赖选择驱动宿主-病原体协同进化的假设。包含纵向分析和横断面分析两类数据，共3个文件，支持宿主免疫基因多态性与病原体菌株特异性互作机制的研究。
文件详解
- README.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：说明数据集的整体内容，包括纵向和横断面分析文件的用途及关键字段定义（如感染状态编码、基因型编码等）。
- Borrelia_longitudinal.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：用于ospC的纵向分析，包含number（样本编号）、transponder（个体ID）、ospC*prev（特定ospC菌株感染状态：0=未感染，1=感染）等字段。
- BorreliaDQB_Xsectional.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：用于基因型互作等横断面分析，包含number（样本编号）、infected（特定ospC菌株感染状态：0=未感染，1=感染）、MyglDQB*（特定DQB等位基因携带状态：0=不携带，1=携带）等字段。
数据来源
论文“MHC class II genotype-by-pathogen genotype interaction for infection prevalence in a natural rodent-Borrelia system”
适用场景
- 宿主-病原体基因型互作研究: 分析MHC II类基因与疏螺旋体菌株的特异性互作及其对感染率的影响。
- 免疫遗传学多态性机制验证: 验证负频率依赖选择维持MHC基因多态性的假设。
- 传染病流行病学分析: 探究自然宿主种群中病原体感染率的遗传驱动因素。
- 协同进化模型构建: 为宿主-病原体协同进化的分子遗传机制提供实证数据支持。
