数据集概述
本数据集为Pocillopora珊瑚种群基因组学研究相关数据，包含线粒体ORF序列比对文件、微卫星与ORF序列文件及SLiM模拟脚本压缩包，可支持珊瑚种群遗传结构、亲缘关系及进化模拟等分析。
文件详解
- ORF_alignement.fas
- 文件格式：FAS
- 字段映射介绍：线粒体ORF序列比对文件，包含Pocillopora珊瑚序列，其中OM-OG、POL-OG为阿曼、波利尼西亚外群样本，OM为阿曼样本，其余为波利尼西亚样本
- Microsatellites_ORF_Pocillopora_Aurelle_et_al.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：未比对的微卫星与ORF序列文件，标注了RAD数据集最终保留的样本
- slim-simulations-Aurelle.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：SLiM模拟所用脚本压缩包，脚本亦可从https://gitlab.osupytheas.fr/aurelle/slim-simulations获取
适用场景
- 珊瑚种群遗传结构分析: 利用基因序列数据研究Pocillopora珊瑚种群的遗传多样性与分化模式
- 亲缘关系与进化研究: 通过ORF序列比对探究珊瑚样本间的亲缘关系及进化历史
- 微卫星标记分析: 基于微卫星序列数据开展珊瑚种群的遗传标记开发与应用研究
- 进化模拟实验: 使用SLiM脚本进行珊瑚种群进化过程的模拟与验证
