数据集概述
本数据集包含澳大利亚谷物基因库180份芸苔科样本的Illumina Infinium Brassica 60K SNP基因分型数据,用于物种鉴定与遗传多样性评估。数据通过基因组分析区分芸苔属不同物种,发现约百分之十八的样本存在物种分类错误,并验证了部分种间杂交个体,为种质资源库的准确利用提供支持。
文件详解
- 文件名称:Supporting Information3_Supplementary Table 2.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含180份芸苔科样本的SNP基因分型数据,涉及样本来源(疑似分类错误样本/随机抽取样本)、基因组类型(A/C基因组)、主成分分析结果、物种分类结果及染色体计数验证信息等字段。
数据来源
论文“High-throughput genotyping for species identification and diversity assessment in germplasm collections”
适用场景
- 种质资源库物种分类校正: 利用SNP分型数据验证芸苔科样本的物种归属,修正分类错误
- 遗传多样性研究: 分析芸苔属不同物种的遗传多样性水平及群体结构
- 种间杂交事件检测: 识别芸苔科样本中的种间杂交个体,研究物种间基因交流
- 农业育种资源筛选: 为芸苔科作物育种提供准确分类的种质资源数据支持