数据集概述
本数据集包含北美蝾螈（Plethodon cinereus）两种形态种群的基因组分析数据，支持长岛地区纯色种群从原同域分布形态分化为邻域分布的研究结论。数据基于双酶切RAD测序技术，涵盖SNP比对信息及分析脚本，用于验证种群单系性及分化模式，共包含4个文件。
文件详解
- README.md
- 文件格式：MD
- 字段映射介绍：包含数据集内容摘要、实验流程及结果背景说明，关联Buckingham et al. (2022)论文的SNAPP分析所用SNP数据来源。
- File_S2_all_snps.xml
- 文件格式：XML
- 字段映射介绍：SNP比对数据文件，存储用于种群基因组分析的所有单核苷酸多态性位点信息。
- File_S1_Plethodon_R_files.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：压缩包文件，包含用于数据分析的R语言脚本文件。
- File_S3_single_snp.xml
- 文件格式：XML
- 字段映射介绍：SNP比对数据文件，存储单个单核苷酸多态性位点的详细信息。
数据来源
论文“Population genomic analyses support sympatric origins of parapatric morphs in a salamander”（Buckingham et al., 2022）
适用场景
- 种群基因组学研究：分析蝾螈形态种群的遗传分化模式及单系性验证。
- 进化生物学研究：探究同域分布形态向邻域分布分化的演化机制。
- 基因组数据分析方法验证：基于双酶切RAD测序技术的SNP数据处理及SNAPP分析流程参考。
- 生物地理学研究：结合地理分布信息，分析蝾螈种群空间分化的基因组学基础。
