Buffalo_CapriviStrip_GeneticFlow_Research_Data

数据集概述

本数据集为纳米比亚卡普里维地带6个非洲水牛种群的基因流研究数据,包含134个个体的10个微卫星基因座分型数据,以及种群采样位置、地理屏障、景观阻力等空间信息,用于对比历史与近期基因流的差异,分析影响基因流的因素,支持种群连通性研究。

文件详解

  • 空间数据文件
  • 文件名称:BuffaloSampleLocations.zip、VetFence.zip、AllMainRivers.zip
  • 文件格式:ZIP
  • 字段映射介绍:包含非洲水牛采样点位置、围栏分布、主要河流等GIS空间数据,支持地理屏障与景观阻力分析
  • 基因型数据文件
  • 文件名称:Buff134_10loc6pop
  • 文件格式:无扩展名
  • 字段映射介绍:134个非洲水牛个体在10个微卫星基因座的分型数据,对应6个种群的遗传结构分析
  • 分析辅助文件
  • 文件名称:AnalysisClip.zip
  • 文件格式:ZIP
  • 字段映射介绍:基因流分析过程中使用的裁剪数据,支持景观阻力模型构建
  • 亲缘关系分析文件
  • 文件名称:Buff118_10classes_SPAGEDI.txt
  • 文件格式:TXT
  • 字段映射介绍:包含118个个体的分类信息、空间坐标及微卫星基因座数据(如BM3517、HEL10等),用于SPAGEDI软件的亲缘关系分析
  • 景观阻力多边形文件
  • 文件名称:UnityResistanceSamplingPolygons.txt、UnityResistanceHomeRangePolygons.txt
  • 文件格式:TXT
  • 字段映射介绍:包含采样区域和家域范围的景观阻力多边形数据,用于评估地理特征对基因流的影响

数据来源

论文“Contrasting historical and recent gene flow among African buffalo herds in the Caprivi Strip of Namibia”

适用场景

  • 种群遗传学研究:分析非洲水牛种群的历史与近期基因流差异,探究遗传结构形成机制
  • 景观遗传学分析:评估地理距离、河流屏障、水源距离等景观因素对基因流的影响
  • 野生动物保护规划:为维持非洲水牛种群连通性提供数据支持,指导保护区管理策略制定
  • 亲缘关系分析:通过微卫星数据计算个体间亲缘关系,研究种群内近交程度与社会结构
  • GIS空间建模:结合采样位置与地理屏障数据,构建景观阻力模型,模拟基因流路径
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 3.5 MiB
最后更新 2026年1月17日
创建于 2026年1月17日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。