数据集概述
本数据集围绕社会变形虫(Dictyostelium discoideum)与伯克霍尔德菌(Burkholderia)的共生特异性展开,包含共生菌的流行率、物种分类、遗传多样性及表型特征相关数据,支持对该独特共生系统形成机制的研究。
文件详解
- Figure3_MLST.Traits.xlsx(XLSX格式):包含多位点序列分型(MLST)及共生相关表型特征数据,关联伯克霍尔德菌菌株的基因型与表型
- BurkholderiaMLSAconcatenatedALN.fas(FAS格式):伯克霍尔德菌多位点序列分析(MLSA)的序列比对文件,用于遗传多样性分析
- Figure1_BurkholderiaPrevalenceScreening.xls(XLS格式):社会变形虫自然分离株中伯克霍尔德菌感染率筛查数据,记录700株样本的感染情况
- Figure6_SporeProductivity.xls(XLS格式):伯克霍尔德菌共生对变形虫孢子生产力影响的实验数据,包含不同菌株处理组的孢子产量统计
数据来源
论文“The specificity of Burkholderia symbionts in the social amoeba farming symbiosis: prevalence, species, genetic and phenotypic diversity”
适用场景
- 微生物共生特异性研究:分析伯克霍尔德菌在社会变形虫宿主中的物种特异性及共生适配机制
- 共生菌遗传多样性分析:基于MLSA序列数据探究伯克霍尔德菌的进化关系与遗传分化
- 共生表型关联研究:通过基因型与表型数据关联,揭示伯克霍尔德菌共生性状的遗传基础
- 宿主-共生菌互作机制研究:利用孢子生产力数据评估共生关系对宿主繁殖适合度的影响
- 微生物生态系统演化分析:以该独特共生系统为模型,探索细菌从猎物向共生体转变的进化路径