布氏锥虫全基因组亚细胞蛋白定位数据集TrypTag

数据集概述

本数据集是TrypTag全基因组蛋白定位项目的数据,包含布氏锥虫(单细胞真核病原体)蛋白亚细胞定位的宽场荧光显微镜图像相关信息。数据集未包含显微图像,而是提供定位摘要、脚本、代码、引物序列及基因ID与图像数据存储DOI的索引。

文件详解

  • 文件名称: readme.docx,文件格式: DOCX,内容: 数据集说明文档,提供项目背景、使用方法、引用规范等信息
  • 文件名称: plate_doi_index.tsv,文件格式: TSV,内容: 孔板编号与对应显微图像数据存储DOI的索引文件
  • 文件名称: id_doi_index.tsv,文件格式: TSV,内容: 基因ID与对应显微图像数据存储DOI的索引文件
  • 文件名称: localisations.tsv,文件格式: TSV,内容: 蛋白定位结果摘要数据,包含基因ID、定位信息等字段
  • 文件名称: localisation_ontology.json,文件格式: JSON,内容: 定位本体定义文件,规范蛋白定位描述术语
  • 文件名称: trypTag_master.zip,文件格式: ZIP,内容: 构建TrypTag数据库所用的脚本、代码、引物序列等压缩文件
  • 文件名称: localisationmodifier_ontology.json,文件格式: JSON,内容: 定位修饰符本体定义文件,补充定位描述的修饰术语

适用场景

  • 寄生虫学研究: 分析布氏锥虫蛋白亚细胞定位规律,探究病原体生命活动机制
  • 分子生物学研究: 研究真核生物蛋白定位与功能的关系
  • 数据库构建参考: 学习TrypTag数据库的构建方法与数据整合流程
  • 生物信息学分析: 结合基因ID索引关联显微图像数据,开展大规模蛋白定位数据分析
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 9.92 MiB
最后更新 2025年12月5日
创建于 2025年12月5日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。