数据集概述
本数据集基于宏基因组学分析，探究不同日粮精粗比下牦牛瘤胃微生物组成及其代谢通路特征，涉及40头青海高原牦牛的分组饲喂实验数据、微生物群落结构及功能代谢通路分析结果，为研究牦牛饲料效率调控机制提供数据支持。
文件详解
- 文件名称：Data statistics after quality control.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射：包含样本编号（Samples）、清洁读段数（Clean reads）、清洁碱基量（Clean base(bp)）、原始读段占比（Percent in raw reads(%)）、原始碱基占比（Percent in raw bases(%)）等质量控制后的数据统计字段
- 文件名称：Assembled and Scaled-Up Statistical Table.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射：包含样本编号（Sample）、Contigs数量（Contigs）、Contigs碱基量（Contigs bases(bp)）、N50长度（N50(bp)）、N90长度（N90(bp)）、最大长度（Max(bp)）、最小长度（Min(bp)）等组装后的数据统计字段
- 文件名称：Original sequence statistics.csv
- 文件格式：CSV
- 内容说明：原始测序序列统计数据文件
- 文件名称：Genetic Prediction Result Statistics Table.csv
- 文件格式：CSV
- 内容说明：基因预测结果统计表格
- 文件名称：CAZy functional annotation abundance table.csv
- 文件格式：CSV
- 内容说明：碳水化合物活性酶（CAZy）功能注释丰度表
- 文件名称：COG functional annotation abundance table NOG_ID.csv
- 文件格式：CSV
- 内容说明：COG功能注释丰度表（含NOG_ID）
- 文件名称：NR Species Annotation Table.csv
- 文件格式：CSV
- 内容说明：NR数据库物种注释表
- 文件名称：KO Abundance Table.csv
- 文件格式：CSV
- 内容说明：KEGG Orthology（KO）功能注释丰度表
适用场景
- 牦牛瘤胃微生物生态学研究：分析不同日粮条件下瘤胃微生物群落结构差异
- 反刍动物营养调控研究：探究日粮精粗比对牦牛饲料效率的影响机制
- 宏基因组功能代谢研究：解析瘤胃微生物代谢通路与能量利用的关联
- 畜牧业精准饲喂技术开发：为牦牛日粮配方优化提供数据支撑
