数据集概述
本数据集包含BV-BRC平台提供的肺炎克雷伯菌（Klebsiella pneumoniae） antimicrobial resistance（AMR）注释数据，通过多种工具生成不同维度的耐药相关注释文件，支持细菌耐药性研究与分析。
文件详解
- 耐药注释类文件
- 文件名称：Kleborate_annotations.csv、SraX_annotations.csv、Abricate_annotations.csv、AMRFinder_annotations.csv、RGI_annotations.csv、DeepARG_annotations.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含菌株（strain）及各类抗生素（如氨基糖苷类、氟喹诺酮类等）获得性耐药标注字段（如AGly_acquired、Flq_acquired）
- 辅助映射类文件
- 文件名称：Kleborate_class_to_columns.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含Kleborate_genes与抗生素类别（如aminoglycoside、Polymyxins）的映射关系
- 药物分类文件
- 文件名称：Drugs_per_class.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：记录药物与耐药类别对应关系
- 补充表格文件
- 文件名称：Supplementary Table 4.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：耐药相关补充数据表格
数据来源
BV-BRC平台
适用场景
- 细菌耐药机制研究：分析肺炎克雷伯菌耐药基因分布与耐药表型关联
- 耐药注释工具对比：比较不同工具（如Kleborate、AMRFinder）的注释结果差异
- 耐药数据库整合：作为标准化AMR注释数据支持跨平台耐药信息整合
- 临床耐药监测：辅助临床肺炎克雷伯菌感染的耐药性预测与治疗方案选择
