数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)AQ1031菌株(含mec-12(e1605)突变及bzIs17转基因标记)的行为实验数据,记录了成年雌雄同体线虫在NGM培养基上的运动行为,包含视频追踪数据、特征提取结果及标准化格式文件,用于线虫神经生物学与行为学研究。
文件详解
- 核心数据文件
- 文件名称:mec-12 (e1605) on food L_2010_10_28__12_37_1066.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为实验的原始追踪数据,记录运动轨迹、骨架 segmentation 等基础观测信息
- 特征提取文件
- 文件名称:mec-12 (e1605) on food L_2010_10_28__12_37_1066_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储由tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,对应实验的运动参数分析结果
- 标准化格式文件
- 文件名称:mec-12 (e1605) on food L_2010_10_28__12_37_1066.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(含wcon格式文件)
- 字段映射介绍:压缩包内为符合wcon标准的线虫行为数据文件,用于跨平台的行为数据交换与整合
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫神经突变体行为分析:研究mec-12基因突变对秀丽隐杆线虫运动行为的影响
- 行为学实验方法验证:基于E. Yemini等的实验方法,验证线虫行为观测的标准化流程
- 运动特征提取算法测试:利用数据集评估tierpsy等行为追踪软件的特征提取效果
- 线虫行为数据库补充:为C.elegans行为数据库提供标准化的实验数据支撑