数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C. elegans)AQ2936品系的行为实验记录,包含基因编辑品系的运动行为监测数据。实验记录了成年雌雄同体线虫在特定培养条件下的行为特征,涉及基因、染色体、品系描述等关键信息,支持线虫行为与基因功能关联研究。
文件详解
- 文件名称:
unc-80 (e1069) nRHO-1 G14V on food L_2012_02_09__11_48___4___4.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为实验的原始监测数据,可能涉及运动轨迹、时间序列等基础行为特征
- 文件名称:
unc-80 (e1069) nRHO-1 G14V on food L_2012_02_09__11_48___4___4.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(含wcon格式文件)
- 字段映射介绍:压缩包内为线虫行为数据交换格式(wcon)文件,记录标准化的行为数据
- 文件名称:
unc-80 (e1069) nRHO-1 G14V on food L_2012_02_09__11_48___4___4_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含提取的线虫行为特征数据,如骨架分段数(25899个)、运动参数等加工后特征
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫遗传学研究:分析unc-80、rho-1基因对秀丽隐杆线虫行为的调控作用
- 生物行为学实验:研究成年线虫在NGM低蛋白培养基、OP50食物条件下的运动行为模式
- 基因功能验证:验证punc-17::rho-1(G14V)、punc-122::GFP等基因编辑元件的表达效果
- 实验方法复现:基于E. Yemini等的实验方法,复现或优化线虫行为监测流程
- 行为特征提取算法测试:利用标准化行为数据评估tierpsy等软件的特征提取性能