数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)AQ495品系gpa-14(pk347)I突变体的行为实验数据,记录了成虫在含OP50食物的NGM培养基上的运动行为。数据包含视频追踪原始文件、特征提取文件及标准化行为数据文件,用于研究该基因突变对秀丽隐杆线虫行为表型的影响。
文件详解
- gpa-14 (pk347)1 on food R_2009_06_02__12_56__12.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为轨迹的标准化数据文件,记录线虫运动的时空坐标及行为参数
- gpa-14 (pk347)1 on food R_2009_06_02__12_56__12_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:线虫行为特征提取数据,包含运动速度、弯曲频率、身体姿态等量化特征
- gpa-14 (pk347)1 on food R_2009_06_02__12_56__12.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:原始视频追踪数据,包含3209个分割骨架的空间坐标及时间序列信息,采样帧率31.8471帧/秒,视频像素分辨率4.95268微米/像素
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫神经遗传学研究: 分析gpa-14基因突变对秀丽隐杆线虫运动行为的影响机制
- 行为表型组学分析: 基于标准化行为数据开展基因突变体的表型差异比较
- 生物运动轨迹建模: 利用骨架数据构建线虫运动的数学模型及行为模式识别
- 神经药物筛选: 作为基准数据集评估药物对线虫行为表型的调控作用
- 基因功能注释: 通过行为表型数据反推gpa-14基因在神经信号通路中的功能