数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)AQ916品系(egl-30(n686); goa-1(n1134)I双基因突变体)的行为实验数据,属于线虫行为数据库的一部分。记录了成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM琼脂培养基中的运动行为,包含视频追踪及特征提取结果,可用于研究基因突变对线虫行为的影响。
文件详解
- 文件名称:egl-30 (n686); goa-1 (n1134) on food L_2010_08_03__12_55_0129.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为的WCON格式数据压缩包,记录运动轨迹相关原始信息
- 文件名称:egl-30 (n686); goa-1 (n1134) on food L_2010_08_03__12_55_0129_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:线虫行为特征提取文件,存储由tierpsy软件分析得到的运动特征数据
- 文件名称:egl-30 (n686); goa-1 (n1134) on food L_2010_08_03__12_55_0129.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为实验的核心数据,如26998个分割骨架数据、时间参数(总时长899秒、帧率30.03帧/秒)、视频像素与微米映射关系(4.49333微米/像素)等
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因突变功能研究: 分析egl-30和goa-1基因变异对秀丽隐杆线虫运动行为的影响
- 神经生物学机制探索: 结合行为数据研究G蛋白信号通路对线虫运动调控的分子机制
- 模式生物行为学分析: 作为标准化线虫行为实验数据,支持模式生物行为学的方法学验证与比较
- 生物信息学特征提取算法评估: 基于tierpsy软件的特征提取结果,验证或优化线虫行为特征分析算法