数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了FX3092 trpa-2(tm3092)I菌株成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验在NGM低蛋白胨琼脂培养基、OP50食物条件下进行,包含视频记录及处理后的行为特征数据,用于研究trpa-2基因相关的线虫行为表型。
文件详解
- 行为特征文件:
M05B5.6 (tm3092) on food R_2010_03_26__14_34_29___4___9_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为特征数据,基于tierpsy软件分析得到的19522个分割骨架相关特征
- 核心实验数据文件:
M05B5.6 (tm3092) on food R_2010_03_26__14_34_29___4___9.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储实验核心数据,关联视频处理后的原始行为记录
- 行为数据压缩文件:
M05B5.6 (tm3092) on food R_2010_03_26__14_34_29___4___9.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩存储的线虫行为数据文件,包含实验过程中的行为轨迹等信息
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究:分析trpa-2(tm3092)突变体线虫的行为表型,探究trpa-2基因在行为调控中的作用
- 模式生物行为学分析:基于视频处理的骨架数据,研究线虫的运动模式、觅食行为等表型特征
- 神经生物学实验验证:结合基因背景与行为数据,验证神经相关基因对行为的调控机制
- 生物信息学工具应用:作为tierpsy软件分析线虫行为的实例数据,用于行为分析算法的测试与优化