数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)IK130菌株(携带pkc-1(nj3)V突变)的行为实验数据,属于线虫行为数据库的一部分。记录了成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM培养基中的运动行为,包含视频追踪数据及特征提取结果,可用于分析pkc-1基因对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 行为数据压缩包
- 文件名称:
pkc-1 (nj3) on food R_2010_07_29__12_34_59___6___6.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为轨迹的WCON格式数据压缩文件
- 特征数据文件
- 文件名称:
pkc-1 (nj3) on food R_2010_07_29__12_34_59___6___6_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:由tierpsy软件提取的线虫行为特征数据文件
- 原始追踪数据文件
- 文件名称:
pkc-1 (nj3) on food R_2010_07_29__12_34_59___6___6.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含26999个分割骨架的原始视频追踪数据,记录帧率30.03帧/秒,视频像素分辨率4.45817微米/像素,实验总时长899.033秒
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析pkc-1(nj3)突变对秀丽隐杆线虫运动行为的影响
- 神经生物学机制探索: 探究蛋白激酶C(PKC)信号通路在线虫行为调控中的作用
- 行为表型分析: 基于视频追踪数据研究线虫摄食状态下的运动模式、速度及轨迹特征
- 基因-行为关联分析: 建立pkc-1基因变异与线虫行为表型的关联模型
- 模式生物实验方法验证: 验证tierpsy软件在秀丽隐杆线虫行为追踪中的应用效果