数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了2011年3月8日在英国剑桥MRC分子生物学实验室开展的LSJ1品系线虫行为实验数据。实验对象为成年雌雄同体线虫,在低蛋白胨NGM琼脂培养基、OP50食物条件下培养,使用tierpsy软件追踪分析,包含视频转换数据、特征数据及原始追踪数据三类文件。
文件详解
- 300 LSJ1 on food R_2011_03_08__15_51_1819.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为视频转换后的wcon格式数据,记录线虫运动轨迹的结构化信息
- 300 LSJ1 on food R_2011_03_08__15_51_1819_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为特征数据,涵盖运动速度、身体弯曲度等行为学量化指标
- 300 LSJ1 on food R_2011_03_08__15_51_1819.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含原始追踪数据,记录线虫在实验过程中的位置、姿态等基础运动信息
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫行为学研究:分析LSJ1品系线虫在特定培养条件下的运动模式、觅食行为等特征
- 模式生物行为机制分析:探究环境因素(如食物、培养基)对秀丽隐杆线虫行为的影响
- 行为数据分析方法验证:用于测试和优化线虫行为追踪软件(如tierpsy)的算法性能
- 遗传学与行为关联研究:为LSJ1品系线虫的基因型与行为表型关联分析提供实验数据支持