数据集概述
本数据集是秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了MT7988品系(携带bas-1基因ad446等位基因)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验于2009年12月14日开展,包含线虫在NGM琼脂培养基上的行为轨迹及特征数据,采用tierpsy软件分析,涉及视频、行为轨迹和特征文件三类数据。
文件详解
- 行为轨迹压缩文件
- 文件名称:
bas-1 (ad446) on food R_2009_12_14__13_02_07___2___9.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为轨迹的wcon格式数据,记录线虫运动的时空坐标等核心轨迹信息
- 行为数据文件
- 文件名称:
bas-1 (ad446) on food R_2009_12_14__13_02_07___2___9.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为实验的原始或预处理数据,支撑行为轨迹的结构化存储与读取
- 行为特征文件
- 文件名称:
bas-1 (ad446) on food R_2009_12_14__13_02_07___2___9_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含由tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,如运动速度、身体弯曲度等量化指标
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析bas-1基因对秀丽隐杆线虫运动行为的调控作用
- 神经生物学实验验证: 验证神经递质相关基因(bas-1参与单胺类神经递质合成)与行为表型的关联
- 行为分析方法优化: 基于tierpsy软件提取的特征,优化线虫行为量化分析算法
- 模式生物行为数据库补充: 为秀丽隐杆线虫行为数据库提供标准化的基因功能行为实验数据支持