数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了NL1146菌株(gpa-6(pk480)X基因突变体)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验于2010年2月26日开展,采用NGM低蛋白胨培养基和OP50食物源,通过Tierpsy软件追踪分析线虫运动行为,包含原始追踪数据和特征提取结果。
文件详解
- 行为追踪数据文件
- 文件名称:gpa-6 (ph480)X on food R_2010_02_26__09_25_14__3.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为追踪的原始数据,包含899.462秒记录时长、每秒25.7732帧的图像数据,以及4.3011微米/像素的尺度转换参数,共19782个分段骨架数据
- 特征提取数据文件
- 文件名称:gpa-6 (ph480)X on food R_2010_02_26__09_25_14__3_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:通过Tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,具体特征字段基于软件标准输出
- 压缩行为数据文件
- 文件名称:gpa-6 (ph480)X on food R_2010_02_26__09_25_14__3.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩格式的线虫行为数据文件,包含实验的原始追踪记录
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫神经行为学研究: 分析gpa-6基因突变对秀丽隐杆线虫运动模式、觅食行为等的影响
- 基因功能验证: 探究gpa-6基因在调控线虫行为中的作用机制
- 药物筛选参考: 作为模式生物行为实验的对照数据,支持神经活性药物的筛选与评估
- 行为分析算法优化: 基于已知突变体的行为特征,优化线虫行为追踪与特征提取算法
- 线虫发育与环境响应研究: 结合培养基和食物条件,分析环境因素对线虫行为的调控作用