数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)NL332品系gpa-1(pk15)V突变体的行为实验数据,包含成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM培养基中的运动行为记录,由MRC分子生物学实验室完成,数据来自线虫行为数据库,可用于研究gpa-1基因对其行为的影响。
文件详解
- 核心数据文件(.hdf5格式,共2个)
- 文件名称:gpa-1 (pk15) on food L_2010_03_04__12_23311.hdf5、gpa-1 (pk15) on food L_2010_03_04__12_23311_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫运动行为的原始数据及特征数据,涉及17957个分段骨架信息,帧率20帧/秒,总时长约900秒,像素分辨率4.02599微米/像素
- 压缩数据文件(.zip格式,共1个)
- 文件名称:gpa-1 (pk15) on food L_2010_03_04__12_23311.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为数据的压缩文件
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫遗传学研究: 分析gpa-1基因对秀丽隐杆线虫运动行为的调控机制
- 生物行为学实验: 研究线虫在特定培养基和食物条件下的行为特征
- 基因功能验证: 验证gpa-1(pk15)突变体的表型与野生型的差异
- 行为数据分析方法优化: 基于tierpsy软件生成的特征数据,优化线虫行为特征提取算法
- 实验室标准化实验参考: 为线虫行为学实验提供标准化的实验方案和数据格式参考