数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)NL787品系gpa-11(pk349)II突变体的行为实验数据,属于线虫行为数据库的一部分。记录了成年雌雄同体线虫在特定培养条件下的行为特征,包含实验设计参数、视频分析结果及行为特征数据,可用于研究该基因突变对线虫行为的影响。
文件详解
- 行为数据压缩文件
- 文件名称:gpa-11 (pk349)II on food r_2010_03_04__13_01_34113.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为的结构化数据文件(WCON格式),记录线虫运动轨迹等核心行为信息
- 特征数据文件
- 文件名称:gpa-11 (pk349)II on food r_2010_03_04__13_01_34113_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为特征提取结果,包含19559个分段骨架数据及相关行为特征参数
- 原始分析数据文件
- 文件名称:gpa-11 (pk349)II on food r_2010_03_04__13_01_34113.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:记录实验基础参数(如总时长899.954秒、帧率26.3158帧/秒、像素分辨率4.29558微米/像素等)及原始视频分析数据
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫遗传学研究: 分析gpa-11基因(pk349)突变对线虫行为模式的影响
- 行为表型分析: 基于骨架数据和特征参数,研究线虫运动轨迹、速度等行为表型特征
- 实验方法验证: 参考标准化实验方案(如30分钟适应期、OP50食物条件),优化线虫行为实验设计
- 生物信息工具应用: 基于Tierpsy软件的分析结果,探索线虫行为特征提取的算法有效性
- 神经生物学研究: 结合基因功能,探究gpa-11基因在调控线虫行为中的神经机制