数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫npr-12(tm1498)IV突变株的行为实验数据,包含实验的基本信息、视频参数及分析结果文件。实验记录了成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM琼脂平板中的行为,使用tierpsy软件进行追踪分析,是研究npr-12基因功能与线虫行为关联的基础数据。
文件详解
- 行为特征文件
- 文件名称:npr-12 (tm1498)IV on food R_2011_02_04__12_53_12__7_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为追踪的特征数据,包含由tierpsy软件提取的运动特征、身体姿态等行为参数
- 原始追踪文件
- 文件名称:npr-12 (tm1498)IV on food R_2011_02_04__12_53_12__7.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:记录线虫行为的原始追踪数据,包含视频帧中线虫的位置、骨架等基础信息
- 行为数据压缩文件
- 文件名称:npr-12 (tm1498)IV on food R_2011_02_04__12_53_12__7.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩存储的线虫行为数据,遵循wcon格式标准,包含标准化的行为记录信息
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 基因功能研究:分析npr-12基因对秀丽隐杆线虫行为的调控作用
- 行为学特征分析:基于追踪数据研究线虫的运动模式、觅食行为等表型特征
- 生物信息学算法验证:作为tierpsy等行为追踪软件的测试数据集,验证算法准确性
- 模式生物实验复现:为相关实验室复现npr-12突变株行为实验提供参考数据
- 神经生物学研究:结合基因背景探究线虫行为背后的神经调控机制