数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫NY248品系(flp-28(gk1075)突变体,回交三次)的行为实验数据,属于C.elegans行为数据库的一部分。记录了2010年1月20日在英国MRC分子生物学实验室开展的实验信息,包括线虫品系、基因背景、实验条件及行为记录数据,共包含3个文件。
文件详解
- 行为记录主文件
- 文件名称:flp-28 (gk1075)X on food R_2010_01_20__10_58_05__4.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为原始记录数据,包含实验时长(898.141秒)、帧率(27.1739帧/秒)、像素分辨率(4.48488微米/像素)及22188个分割骨架数据
- 行为特征文件
- 文件名称:flp-28 (gk1075)X on food R_2010_01_20__10_58_05__4_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储由tierpsy软件提取的线虫行为特征数据
- 压缩数据文件
- 文件名称:flp-28 (gk1075)X on food R_2010_01_20__10_58_05__4.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含wcon格式的行为数据压缩包
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析flp-28基因对秀丽隐杆线虫行为的调控作用
- 模式生物行为学分析: 基于骨架数据和特征文件研究线虫的运动模式、觅食行为等
- 实验条件标准化验证: 参考实验中的培养条件、记录参数,优化线虫行为实验设计
- 行为分析软件应用: 以tierpsy软件处理的结果为基础,开展行为分析算法的对比或优化
- 遗传学与行为关联研究: 结合突变体背景,探索基因变异与行为表型的关联机制