数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫QL22 ins-10(tm3498)菌株的行为实验记录,属于C.elegans行为数据库的一部分。记录了成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM低蛋白琼脂培养皿中的行为,包含视频追踪数据、特征提取结果等,可用于分析该基因突变株的行为表型。
文件详解
- 核心数据文件(.hdf5格式,共2个)
- 文件名称:ins-10 (tm3498) on food R_2012_10_04__09_21_4841.hdf5、ins-10 (tm3498) on food R_2012_10_04__09_21_4841_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为的原始追踪数据(如骨骼分割信息,共24965个分段骨骼)、行为特征提取结果(基于tierpsy软件分析)
- 压缩数据文件(.zip格式,共1个)
- 文件名称:ins-10 (tm3498) on food R_2012_10_04__09_21_4841.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为数据的WCON格式压缩文件,用于存储标准化的行为观测记录
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫遗传学研究:分析ins-10(tm3498)基因突变对秀丽隐杆线虫行为表型的影响
- 行为生物学分析:基于视频追踪数据研究线虫的运动模式、觅食行为等特征
- 生物数据标准化应用:利用WCON格式文件开展跨平台的线虫行为数据整合与比较
- 实验方法验证:参考E. Yemini等人的实验方法(doi:10.1038/nmeth.2560)验证线虫行为实验的可重复性