数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)行为数据库的一部分,记录了RB1030品系(snf-9基因ok957突变体)成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM培养基上的行为实验数据,包含实验条件、视频参数及处理后的行为特征文件,可用于分析该基因突变体的行为表型。
文件详解
- 文件名称:snf-9 (ok957)IV on food R_2009_11_17__15_2637_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:推测包含线虫行为特征数据,如运动轨迹、身体姿态、速度等由tierpsy软件提取的行为学特征参数
- 文件名称:snf-9 (ok957)IV on food R_2009_11_17__15_2637.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:推测包含实验原始数据或处理后的核心数据,如视频帧对应的线虫轮廓、坐标等基础信息
- 文件名称:snf-9 (ok957)IV on food R_2009_11_17__15_2637.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(内含wcon格式文件)
- 字段映射介绍:wcon格式为线虫行为数据标准格式,推测包含线虫运动轨迹的时间序列数据,如位置、角度、弯曲度等
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析snf-9基因ok957突变对秀丽隐杆线虫行为表型的影响
- 行为学实验方法验证: 基于E. Yemini等人的实验方法,验证标准化线虫行为实验的可重复性
- 线虫行为特征分析: 利用提取的运动轨迹、姿态等特征,研究突变体线虫的觅食、运动模式差异
- 生物信息学工具应用: 测试tierpsy等线虫行为分析软件在突变体数据处理中的效果与准确性