数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)RB1802菌株(携带F54E4.4基因ok2336突变)的行为实验数据,属于线虫行为数据库的一部分。记录了成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM培养基上的行为特征,包含原始视频衍生的运动轨迹、骨架数据及行为特征参数,用于研究基因对其行为的影响。
文件详解
- 核心数据文件
- 文件名称:F45E4.4 (ok2330)X on food L_2011_08_09__12_1036.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为实验的原始跟踪数据,包含视频帧对应的线虫骨架坐标、时间戳等基础运动信息
- 特征数据文件
- 文件名称:F45E4.4 (ok2330)X on food L_2011_08_09__12_1036_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储提取的线虫行为特征参数,基于tierpsy软件分析得到,涵盖运动速度、弯曲度、身体姿态等量化指标
- 行为数据压缩文件
- 文件名称:F45E4.4 (ok2330)X on food L_2011_08_09__12_1036.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩存储的线虫行为数据文件,包含标准化格式的行为轨迹信息
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫遗传学研究: 分析F54E4.4基因ok2336突变对RB1802菌株行为表型的影响
- 行为特征量化分析: 基于提取的运动特征参数,研究线虫在食物环境中的移动模式、探索行为等
- 基因功能验证: 通过对比野生型与突变株行为差异,验证目标基因在行为调控中的作用
- 生物行为数据库补充: 作为线虫行为数据库的组成部分,支持大规模线虫行为数据的整合与比较研究