数据集概述
本数据集记录了2011年8月在英国MRC分子生物学实验室开展的秀丽隐杆线虫(C.elegans)行为实验数据。实验对象为携带F54E4.4基因ok2336变异的RB1802品系成虫,在NGM低蛋白琼脂培养基上以OP50大肠杆菌为食,通过视频追踪分析其行为特征,包含原始视频衍生数据及行为特征提取结果。
文件详解
- 行为特征文件:
- 文件名:F54E4.4 (ok2330)X on food R_2011_08_09__11_13_2783_features.hdf5
- 格式:HDF5
- 内容:包含线虫行为特征数据,如运动轨迹、身体姿态等结构化特征值
- 原始行为数据压缩包:
- 文件名:F54E4.4 (ok2330)X on food R_2011_08_09__11_13_2783.wcon.zip
- 格式:ZIP
- 内容:压缩存储的线虫行为原始记录文件(wcon格式)
- 核心实验数据文件:
- 文件名:F54E4.4 (ok2330)X on food R_2011_08_09__11_13_2783.hdf5
- 格式:HDF5
- 内容:包含实验元数据、视频参数及基础行为测量数据,如总时长(898.967秒)、帧率(30.03帧/秒)、像素分辨率(4.89022微米/像素)等
数据来源
英国MRC Laboratory of Molecular Biology(William R Schafer实验室)
适用场景
- 线虫基因功能研究:分析F54E4.4基因变异对秀丽隐杆线虫行为模式的影响
- 神经行为学实验:研究线虫在特定培养基和食物条件下的运动、觅食等行为特征
- 分子生物学实验验证:验证基因编辑线虫品系的表型差异
- 行为数据分析算法训练:为线虫行为追踪软件(如tierpsy)提供标注数据
- 模式生物实验标准化:作为秀丽隐杆线虫行为实验的标准化数据集参考