数据集概述
本数据集是秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了2010年4月22日开展的RB1883品系(携带trpl-2基因ok2433等位基因)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验在NGM低蛋白胨琼脂培养基、含OP50食物的培养皿中进行,使用tierpsy软件追踪分析,包含行为特征、原始追踪及标准化格式文件。
文件详解
- 文件名称:W03B1.2 (ok2433) on food L_2010_04_22__15_59_43115_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为特征数据,包含由tierpsy软件提取的运动、形态等行为特征参数
- 文件名称:W03B1.2 (ok2433) on food L_2010_04_22__15_59_43115.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储实验原始追踪数据,包含线虫运动轨迹的基础记录
- 文件名称:W03B1.2 (ok2433) on food L_2010_04_22__15_59_43115.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(含wcon文件)
- 字段映射介绍:压缩包内为标准化的线虫行为数据交换格式文件,用于跨平台数据共享
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析trpl-2基因ok2433等位基因对秀丽隐杆线虫行为的影响
- 行为表型分析: 基于追踪数据研究线虫运动模式、觅食行为等表型特征
- 实验方法验证: 参考E. Yemini等提出的实验方法,验证线虫行为实验的标准化流程
- 生物信息学工具评估: 测试tierpsy等线虫行为追踪软件的数据分析效果
- 神经生物学研究: 结合基因背景探究线虫行为背后的神经调控机制