数据集概述
本数据集属于秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了RB2594品系(ins-22(ok3616)III突变体)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验遵循标准协议,使用NGM低蛋白胨培养基和OP50食物源,通过Tierpsy软件采集并分析线虫的运动行为,包含视频衍生的特征数据与骨架分割信息。
文件详解
- 文件1:
ins-22 (ok3616) on food L_2011_06_09__10_29_50___6___1.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:推测为包含线虫行为数据的WCON格式压缩文件,可能记录运动轨迹、时间序列等核心行为信息
- 文件2:
ins-22 (ok3616) on food L_2011_06_09__10_29_50___6___1_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储由Tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,可能包含运动速度、身体弯曲度、头部摆动频率等量化指标
- 文件3:
ins-22 (ok3616) on food L_2011_06_09__10_29_50___6___1.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含26862个分割骨架数据,对应实验总时长899.033秒、帧率30.03帧/秒的原始或处理后图像衍生数据
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究:分析ins-22基因缺失对秀丽隐杆线虫运动行为的影响,探究该基因在行为调控中的作用
- 行为表型分析:基于骨架数据和特征参数,量化突变体线虫的运动模式、觅食行为等表型差异
- 实验方法验证:验证Tierpsy软件在线虫行为实验中的数据采集与特征提取效果
- 神经生物学研究:结合线虫神经机制,探讨基因-行为关联的神经调控通路