数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)行为数据库的一部分,记录了RB709品系(snf-7(ok482)III基因突变)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验于2009年11月开展,使用NGM低蛋白胨培养基和OP50食物源,通过tierpsy软件追踪分析线虫行为,包含视频转换数据、特征数据等文件。
文件详解
- snf-7 (ok482)III on food L_2009_11_19__11_51_3185.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为数据的WCON格式压缩文件,记录线虫运动轨迹等基础行为信息
- snf-7 (ok482)III on food L_2009_11_19__11_51_3185_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:线虫行为特征数据文件,存储由tierpsy软件提取的行为特征参数
- snf-7 (ok482)III on food L_2009_11_19__11_51_3185.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:线虫行为原始追踪数据文件,包含总时长、帧率、像素分辨率、分割骨架数量等实验基础参数
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因突变行为学研究:分析snf-7(ok482)III基因突变对秀丽隐杆线虫运动行为的影响
- 分子生物学实验验证:验证特定基因在调控线虫行为中的作用机制
- 行为学实验方法参考:借鉴实验所用的培养基、食物源、追踪软件等实验方案设计新的线虫行为实验
- 生物信息学数据分析:利用HDF5格式的特征数据进行线虫行为特征的挖掘与分析