数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)RM2702 dat-1(ok157)III品系的行为实验数据,属于线虫行为数据库的一部分。记录了成年雌雄同体线虫在特定培养条件下的行为观测结果,包含原始追踪数据、特征提取数据及标准化格式数据,可用于线虫行为模式与基因功能关联研究。
文件详解
- 核心数据文件
- 文件名称:dat-1 (ok157) on food R_2009_11_18__11_35_3964.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为的原始追踪数据,包含时间序列的位置、骨架 segmentation 等基础观测信息
- 文件名称:dat-1 (ok157) on food R_2009_11_18__11_35_3964_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储行为特征提取数据,包含基于原始追踪计算的运动参数、行为模式等衍生特征
- 文件名称:dat-1 (ok157) on food R_2009_11_18__11_35_3964.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(含wcon格式文件)
- 字段映射介绍:压缩包内为标准化的线虫行为数据交换格式文件,包含结构化的行为观测记录
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析dat-1基因(ok157等位基因)对秀丽隐杆线虫行为模式的影响
- 神经生物学实验验证: 验证E. Yemini等人提出的线虫行为观测方法在特定品系中的适用性
- 行为特征提取算法评估: 基于tierpsy软件提取的特征数据,评估线虫行为特征量化方法的有效性
- 模式生物标准化实验参考: 为线虫行为学实验提供标准化培养条件(NGM琼脂、OP50食物)下的对照数据