数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)N2品系的行为实验记录,由Schafer Lab于2010年8月19日在英国剑桥MRC分子生物学实验室完成。实验记录了线虫在含OP50食物的NGM琼脂培养基上的行为,包含视频追踪数据及特征提取结果,属于C.elegans行为数据库的一部分。
文件详解
- 核心数据文件
- 文件名称:N2 on food L_2010_08_19__10_57_30__1.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为的原始追踪数据,如26288个分割骨架信息、时间序列位置数据等基础观测记录
- 特征提取文件
- 文件名称:N2 on food L_2010_08_19__10_57_30__1_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:由tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,涵盖运动轨迹、身体姿态等量化特征
- 行为数据压缩包
- 文件名称:N2 on food L_2010_08_19__10_57_30__1.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为数据的wcon格式压缩文件,用于标准化行为数据存储与交换
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫神经生物学研究: 分析N2品系线虫在摄食状态下的行为模式,探究神经机制对行为的调控
- 行为特征量化分析: 利用提取的特征数据研究线虫运动轨迹、身体弯曲频率等行为指标
- 实验方法验证: 参考实验方案(Yemini et al.方法)验证线虫行为实验的标准化流程
- 生物行为数据库补充: 作为C.elegans行为数据库的组成部分,支持大规模线虫行为数据的整合分析
- 计算机视觉应用: 基于视频追踪数据优化线虫行为识别算法,提升生物图像分析精度